Научно-методическая деятельность актива музея происходит путем проведения консультаций, а также рецензирование научно-экспозиционной и экскурсионной тематики по истории развития науки и техники со специалистами музеев Кривого Рога.

Лицей разрабатывает проект научно-исследовательской станции и зимнего сада, в котором предполагается ведение экологических исследований, одновременно сопроводительное оздоровление детей и педагогов.

Научно-исследовательской работой педагогов руководят заместители директора лицея, а исследовательской работой лицеистов — научные руководители, лаборанты и другие рабочие. Все они имеют специальное образование и проходят обязательную переподготовку при лицее как Центра экологического образования города и Регионального центра переподготовки педагогических работников Днепропетровского областного института последипломного педагогического образования.